Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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