Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.59□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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