Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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COL4A6Q14031 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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COL4A6Q14031 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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