Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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