Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXD4Q12950 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXD4Q12950 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXD4Q12950 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXD4Q12950 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXD4Q12950 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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FOXD4Q12950 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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FOXD4Q12950 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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