Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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