Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ACTBP12-201ENST00000435871 418 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP000911.4-201ENST00000532272 516 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC007751.2-201ENST00000534173 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL139351.1-201ENST00000622092 320 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 NPM1P46-201ENST00000399556 865 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TRGVA-201ENST00000413819 285 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC010880.1-202ENST00000427950 432 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PRB4-202ENST00000445719 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SL201P-201ENST00000482306 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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