Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms