Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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