Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
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