Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PDGFRLQ15198 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDGFRLQ15198 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 508.6 ms