Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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