Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
EXOSC2Q13868 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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