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| FHL3 | Q13643 | GVINP1-202 | ENST00000531871 | 7271 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AGO2-201 | ENST00000220592 | 14581 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC000374.1-201 | ENST00000434698 | 1745 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC02389-201 | ENST00000535058 | 3546 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | CFL2-201 | ENST00000298159 | 6747 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | MTND4P23-201 | ENST00000447723 | 1363 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AL138820.1-201 | ENST00000617901 | 5305 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | FOXN2-201 | ENST00000340553 | 5408 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC012020.1-201 | ENST00000624541 | 1728 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | SMIM18-201 | ENST00000517349 | 905 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC008694.2-201 | ENST00000517591 | 306 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AZIN1-AS1-203 | ENST00000517996 | 756 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AP000769.2-201 | ENST00000602344 | 396 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC138035.1-202 | ENST00000604669 | 683 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AP000569.1-201 | ENST00000607953 | 591 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC004908.2-201 | ENST00000609090 | 574 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL133173.2-201 | ENST00000614270 | 90 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL158209.2-201 | ENST00000619266 | 216 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AP006248.2-201 | ENST00000623309 | 592 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AP002505.2-201 | ENST00000623585 | 696 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC124864.2-201 | ENST00000624736 | 186 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ACTR3BP2-202 | ENST00000623630 | 1338 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | GYPA-202 | ENST00000360771 | 2659 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | C1orf141-202 | ENST00000371006 | 2053 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | CLVS1-201 | ENST00000325897 | 3486 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ACE2-202 | ENST00000427411 | 3507 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | MACF1-232 | ENST00000567887 | 24319 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AKAP4-201 | ENST00000358526 | 2881 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC024560.2-201 | ENST00000507981 | 1497 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ST8SIA4-201 | ENST00000231461 | 6303 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ELF2-203 | ENST00000379550 | 3278 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF382-201 | ENST00000292928 | 8329 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC00919-201 | ENST00000561513 | 1658 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | TC2N-203 | ENST00000435962 | 5146 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | MYBPC1-206 | ENST00000541119 | 3533 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | SRPK2-201 | ENST00000357311 | 3700 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | LRRN3-204 | ENST00000451085 | 3725 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | SLC28A3-201 | ENST00000376238 | 4887 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | ATF2-212 | ENST00000426833 | 4132 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| FHL3 | Q13643 | EIF2A-201 | ENST00000273435 | 2083 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |