Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms