Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CXCL3P19876 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms