Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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