Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms