Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms