Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms