Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms