Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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