Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LINC00587B1AMM8 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms