Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SALL3Q9BXA9 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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