Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MTERF3Q96E29 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms