Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.120-201ENST00000614195 252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CSTL1-205ENST00000619238 477 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TNNT3-218ENST00000641787 924 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC130689.1-201ENST00000451056 408 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 FTLP18-201ENST00000453860 523 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC027338.2-201ENST00000504382 526 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01411-206ENST00000515513 770 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC048344.2-201ENST00000547280 147 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 EIF5AP3-201ENST00000589460 462 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC084879.1-201ENST00000636165 1201 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms