Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms