Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
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