Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SCAPQ12770 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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