Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms