Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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HECTD4Q9Y4D8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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HECTD4Q9Y4D8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HECTD4Q9Y4D8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HECTD4Q9Y4D8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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