Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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