Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms