Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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