Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEF1Q9UBV8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms