Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms