Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms