Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms