Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms