Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms