Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP74Q9C0B2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP74Q9C0B2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms