Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM8Q9BZR9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms