Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC11CQ9BY50 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC11CQ9BY50 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms