Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms