Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms