Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms