Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms