Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNS1Q96KK3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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