Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms