Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms